常见细胞污染分类和污染的处理

常见细胞污染分类和污染的处理

常见细胞污染

细胞污染——培养物出现浑浊、混浊。培养液pH值升高,液黄。细胞异常的形态,如胞质内细菌吞噬体。细胞的生长速率减缓,对数生长期变得不规律。异常的细胞死亡或细胞溶解情况。

 

真菌污染——培养液可能出现异味。培养皿内有异常的颜色、纹理或斑点。细胞显示出不正常的细胞形态,如真菌吞噬体或真菌丝状体。细胞的生长速率可能受到抑制,细胞数量不断减少。

 

支原体污染——支原体污染通常不会导致明显的细胞培养液变化。因此,支原体污染通常需要PCR或DNA杂交来检测。可能出现感染迹象,如出现包涵体或囊泡。细胞的生长速率减缓。

 

常见污染处理

因污染会改变细胞表型,在细胞种子充足及排除污染因素的情况下,首先丢弃污染细胞,重新复苏。

在未检测的情况下沿用当前细胞试剂及耗材可能导致污染扩散,应及时灭菌或丢弃。

 

如果怀疑细胞培养受到污染,应立即采取行动来确认并解决问题。常见的处理方法包括:

 

1.隔离:将受污染的培养物隔离,并最后处理污染细胞,以防止污染蔓延到其他培养物中。

 

2.污染源排除:查找和消除污染的来源,可使用无抗LB摇菌培养或污染检测试剂。

 

3.更换培养液:将受污染的培养液更换为新的培养液,细菌污染添加敏感抗生素如氨苄青霉素,真菌添加两性霉素B,支原体添加氧氟沙星以控制污染。

 

4.细胞重新传代:如有必要,将细胞重新传代到新的培养皿中,离心速度低于平时,200-300g。

 

5.污染检测:进行污染检测,以确认污染的类型和程度,从而采取适当的措施。

 

操作手册

● 原代细胞提取

● 血清更换注意事项及步骤

● 血清储存及化冻

● 持续更新中

 

原代细胞提取-1

固体组织样品(肝,肺,肿瘤等)

1.分离组织后立即移入超净台操作(<20min),或放入组织保存液中四度保存(不超过48h)。

注意:以下步骤均需无菌操作,且保持低温!

2.取一无菌小皿,加入3ml预冷的PBS,放入组织清洗。重复此步骤一次。

3.用无菌剪和无菌镊(高温高压灭菌)去除脂肪或坏死区域等非目标组织。

4.转移组织块至一无菌15ml/50ml离心管中,加入组织体积10倍的advanced DMEM/F12培养基(缓冲液可自行调整,与后续培养体系一致)。离心管置于冰上,用无菌剪将组织剪成肉泥状。(此步骤注意低温)

5.四度600g离心5分钟,去上清,加入消化液(浸没组织),37℃摇床(800rpm)消化15min,视解离状态调整消化时间,一般不超过45min。(消化液需视组织类型自行调整。一般组成为胶原酶1和4,浓度为400-1000U/ml,以及核酸酶5-20U/ml,可选择添加10uM ROCK抑制剂以提高组织活率。)

 

原代细胞提取-2

6.消化结束立即冰上,加入体积6%的血清终止消化,四度离心弃上清,用巴氏管吸取1-2ml全培养基重悬后细胞滤网过滤,根据后续目的和细胞类型选择滤网大小(类器官需要细胞团一般选择较大的100um,建库的单细胞悬液一般选择70um或更小)。

7.视上一步沉淀颜色选择是否裂红,裂红至沉淀无明显红色即可。裂红液现配,至少10ml,常温避光裂红10min。

8.用巴氏管充分混匀细胞悬液,吸取10ul细胞悬液与2x台盼蓝混匀后计数板计数。一般细胞活性>85%为达标。如不达标,则低速(200-300g)四度离心后弃上清,重悬,再次计数和测量活性,直至达标。)

9.计算所需细胞数量并进行下一步操作,直接种板培养,点胶,或上机等。

 

液体样品(血液,胸水,腹水等)

1.直接600g四度离心5min后弃上清,用medium重悬清洗两次。

2.过滤可选,直接进入裂红判断步骤

3.后续步骤同上。

微生物培养的污染因素及预防方法

微生物培养的污染因素及预防方法

随着现代生物学研究的发展,微生物培养成为了重要的实验手段之一。然而,在进行微生物培养过程中,存在着许多污染因素,这些污染因素可能会对实验结果产生影响或者导致实验结果不准确。下面将介绍一些常见的微生物培养的污染因素以及相应的预防方法。

1.培养箱内的风速和风向对于保持温度的均一性以及避免污染都非常重要。一般来说,适当的风速和风向可以帮助培养箱内的温度保持均一,有利于微生物的正常生长。然而,当风速过大时,可能会导致培养基干裂,从而影响培养结果的准确性。另外,药典要求培养皿倒置培养,这是因为经过多次验证发现,当培养箱运行时的风向与培养皿盖的朝向不一致时,容易引入空气中的灰尘、杂菌等,从而污染培养物。因此,在使用培养箱的过程中,需要注意风速和风向的控制,并尽量与培养皿盖的朝向一致。

2.培养皿由平底和盖组成,一些微生物实验室常用的培养皿直径为90mm,采用顶盖封装。然而,由于不同厂家制造的培养皿的成型工艺和参数不同,平底和盖之间的间隙也存在差异。这些间隙虽然能够满足需氧型微生物对氧气的需求,但也增加了污染的可能性。经过实验证实,在同样的培养条件下,间隙大的培养皿比间隙小的培养皿更容易受到污染。此外,间隙的大小不同还会导致培养皿内培养基的水分蒸发不一致,从而影响培养结果数据的一致性。因此,在使用培养皿的过程中,需要选择质量可靠的培养皿,并注意平底和盖之间的间隙情况。
3.微生物生长需要一定的湿度条件。湿度对微生物生长的影响是通过影响微生物细胞内水分活度进而影响其新陈代谢来实现的。不同微生物的生长对湿度有一定的要求,一般来说,细菌最为敏感,酵母和霉菌次之。降低湿度会使微生物的水分活度降低,从而减慢其生长速度。因此,在微生物培养的过程中,需要保持适宜的温度和湿度,以有利于微生物的生长。培养箱内湿度的来源主要有培养基的水分散失、湿度自动调控系统以及培养箱所在的环境。因此,在使用培养箱的过程中,需要控制湿度,保持适宜的生长环境。

4.培养物溢洒是指含有生物危险物质的液体或固体物质意外与包装材料分离的过程。一旦发生生物危害物品的溢出,尤其是含病原微生物的培养物的溢出时,会导致微生物的生长和繁殖,从而引起培养箱的污染。为了预防交叉污染,当发生培养物溢洒时,需要及时清理和消毒培养箱。应该使用有效的消毒剂对培养箱的内壁以及接触溢出物品的材料进行消毒或高压灭菌。此外,如果溢洒物中含有破碎的玻璃等材料,不得直接用手取走或弃置,应该使用硬纸板和镊子等工具处理,并将处理物放置在安全的废弃物容器中。最后,对清洁工具也需要进行消毒处理,以确保卫生安全。

5.培养箱需要放置在洁净、干燥、通风良好的自然环境中。如果环境中空气洁净度不够高,容易滋生细菌、真菌和病毒等微生物,并通过平底和盖之间的间隙污染培养基,从而影响培养结果数据的准确性。因此,在使用培养箱的过程中,需要注意放置环境的卫生和通风状况,尽量避免自然环境的污染。


综上所述,微生物培养过程中存在着多种污染因素,这些因素可能会对实验结果产生影响或导致实验结果不准确。为了保证实验结果的准确性,需要在使用培养箱进行微生物培养时,注意控制风速和风向、选择合适的培养皿、控制湿度、避免培养物溢洒以及注意自然环境的卫生状况。只有这样,我们才能够获得可靠且准确的微生物培养结果。

植物组培微生物污染控制新能手 PTC3

植物组培微生物污染控制新能手 PTC3 植物组培广泛应用于植物科研:如模式植物,作物育种等;工厂化生产:如观赏花卉植物,中药材生产,园 林园艺等,但是组培过程中种苗的污染,尤其当规模扩大后,污染控制,尤其是真菌的污染清除和抑制是广大工 作者最头疼的问题。 作为全球著名且专业的植物组培产品供应商美国PhytoTechnology Laboratories (简称Phytotech或PTL)专门为 植物组织培养的污染和微生物抑制和清除而研发的专利产品——PTC3 TM(Plant Tissue Culture Contamination Control),可以有效抑制由于空气、灭菌不彻底、交叉污染、外植体消毒等各种原因导致的植物组培苗的细菌、 真菌和农杆菌污染清除与预防。

相对传统抗生素,如头孢、羧苄等抑制微生物污染,PTC3具有非常明显的优势:

 广谱:能广泛抑制和清除细菌和真菌污染,并防止真菌孢子的萌发

 使用方便:热稳定,无需过滤灭菌,可以直接加入培养基一起高压灭菌,或者无需灭菌直接添加使用

 效果稳定:通过抑制微生物多种酶活而达到抑菌效果,从而避免耐药突变体产生

 用量小:按照 0.02-0.2%(v/v)添加,100ml 的 PTC3可用于 50-500L 体积培养基

培养过程中无添加抗菌剂(左侧)和添加 PTC3(右侧)的抑菌效果对比 www.jinpanbio.com 021-50837765 上海金畔生物科技有限公司 Email:customer@jinpanbio.com 北京:021-50837765 上海: 021-63599871 广州:020-38105753 成都: 028-64600404 全国客服热线:021-50837765 培养过程中无添加抗菌剂、市场同类产品和 PTC3 的对常见 3 种污染微生物的抑制效果(抑菌剂均按照 0.2 v/v%添加),枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)、大肠杆菌(Escherichia coli)和农杆菌(Agrobacterium tumefaciens)的生长率在含有 0.2% (v/v) PTC3 或同类 竞争产品的 MS 培养基均受到明显的抑制 PhytoTech 是美国著名的植物培养基供应商,公司发展至今已成为世界顶级植物研究领域的试剂与原料供应 商。 PhytoTech 是国际最早通过 ISO 9001:2000 质量体系认证的植物组织培养基公司,所有产品均按照 cGMP 标准生产和包装,所有产品的生产过程均受到严格的质量控制,每个产品的物理学、化学、生物学特性都经过了 严格检测,并经过组织培养测试。

除 PTC3以外,还有如下热销产品:

 预混培养基:MS,B5,N6,NB,WPM,LS 等百余种

 凝胶剂:琼脂,结冷胶,卡拉胶等

 抗生素与抗性筛选剂:特美汀,潮霉素 B,草铵膦,草甘膦,G418,头孢,羧苄等

 激素:玉米素,赤霉素,茉莉酸甲酯,IAA,IBA,NAA,2ip,6BA,独脚金内酯等

上海金畔生物科技有限公司自 2006 年开始将 Phytotech 引进中国,是目前 Phytotech 的中国区独家一级代理商, 10 多年优质的产品服务体验得到了国内广大用户的认可。目前在国内,我们备有大量现货,方便大家便捷订购和使用,专业优质的技术服务让您订购无忧。

PCR污染有好的解决方法吗?

生物实验,大多数实验检测都是微观的,基于细胞,分子,蛋白水平,而这些微观样本对外界环境的影响敏感,比如温度、ph值、酶解、损伤等,在我们尽力呵护样本的生存环境的同时,污染也是需要注意的头等大事,要坚决避免环境中的“杂质”的乱入,包括样本污染,试剂仪器交叉污染、产物气溶胶污染等对实验结果的影响。“易查不易察”,污染来的悄无声息,防不胜防,假阳性结果让无数生物学子抓狂和崩溃。

小编今天就来扒一扒生物实验室污染之PCR实验污染你不知道的事。

在众多的生物实验室,分子生物学检测方法如PCR因其高灵敏度、快速、操作方便等优势已经被广泛应用,不过正是由于它灵敏度极高,极微量的污染源都有可能导致检测结果的假阳性,所以对环境污染的控制也极为严格。面对众多的污染源,比如样本交叉污染、试剂仪器交叉污染、克隆质粒污染、PCR扩增产物污染、还有极容易忽视的气溶胶污染,气溶胶是由固体或液体小质点分散并悬浮在气体介质中形成的胶体分散体系,在空气与液体面摩擦时,比如在操作时比较剧烈地摇动反应管,开盖时、吸样时及污染进样枪的反复吸样都可形成气溶胶而污染。据计算一个气溶胶颗粒可含48000拷贝,因而由其造成的污染是一个非常重要而被忽视的污染源。

虽然这些污染对PCR实验结果的影响已经受到了广泛重视,多数实验室对污染控制都采取了各种办法,比如定期大扫除清理、划分操作区域、试剂分装、操作谨慎、重复实验、多角度验证结果。但是微量的核酸片段就能被扩增,所以对污染物的控制不仅仅是做到这些就能够杜绝和避免的,关键是需要从源头控制。目前多数生物试验室,分子实验每天都在大规模进行,污染源已经无处不在,特异性的,非特异性的,同源的,非同源的,广泛分布在样本容器、实验室台面,试剂溶液中、仪器表面内管附着等等,你以为普通的清理就能解决这些污染源吗?必须是不行的,实验室大拿们都为了清除这些污染源研究出好多种方法,整理跟大家共享。

传统方式

原理

优势

不足

酒精擦拭

将核酸沉淀,擦拭后保证污染表面污染得到一定程度缓解

简单、方便、成本低

不彻底(核酸片段本身没有变化,仍然存在导致气溶胶污染的可能性)、细小孔径器材无法清除

修饰

标记遗传物质,阻止聚合酶与核酸的结合,从而抑制DNA扩增

效果相对好

反应可逆、成本高、试剂可能具有不安全影响

酶解

酶可将长链的核酸分子降解成小片段

速度快,效果相对较好

降解的核酸中仍有大片段存在,具有完整的遗传信息,可通过PCR扩增出完整的片段、成本高

高压变性

高压可将核酸降解成20~30bp的小片段

彻底,成本低

仅适用于耐高压材料,更无法应用实验操作台和大型的实验设备

紫外照射

PCR产物中嘧啶碱基会形成二聚体,延伸终止

方便,范围广,成本低

仅对500bp以上长片段有效,对短片段效果不大,且并不是DNA链中所有嘧啶均能形成二聚体,且UV照射还可使二聚体断裂

纵然有这么多解决核酸污染源的办法,但是大多数实验室却由于使用不方便、操作复杂、成本高、危害大而没有持续采用,实验室累积的污染也就越来越多,有些实验者甚至在ddH2O中扩增出了条带,结果可重复性差、投稿文章被质疑,不得不重新实验,当然在实验之前,必须要彻底清除这些污染源,这么严重的污染如何高效的清除,是一个迫在眉睫的问题。目前国外学者经过不断研发拓展,有一款清除剂DNA-ExitusPlus已经问世,并得到了Nature Methods的推荐,此款清除剂纯绿色配方,能够将污染源的核酸片段彻底降解成核苷酸为单位的极小片段,此过程不可逆,避免了污染重复的可能性,使用方便,使用与所有台面,仪器擦拭,小部件浸泡等,无污染,无腐蚀性,对人体无危害。简直是广大核酸污染受害者的福音啊。

小编当初在实验室就遇到了PCR污染,可苦于当时不知道世上竟有如此神器,实验反反复复折腾了好多次才得到圆满结果,好东西就要分享,在此推荐给大家,希望对各位看官有所帮助。

PCR污染有好的解决方法吗?

新型专利植物组培抗菌保护剂——Plant Preservative Mixture(PPM)

植物组培广泛应用于植物科研:如模式植物,作物育种等;工厂化生产:如观赏花卉植物,中药材生产,园林园艺等,但是组培过程中种苗的污染,尤其是真菌和内生菌的污染是广大工作者最头疼的问题。美国Plant Cell Technology(简称PCT)专门为植物组织培养而研发的专利产品——PPMTM,可以有效抑制由于空气、灭菌不彻底、交叉污染、外植体消毒等各种原因导致的植物组培苗的细菌、真菌和农杆菌污染清除与预防。

产品特点:

  1. 无毒性——PPMTM是一种热稳定的抗菌剂,用于植物组织培养中植物的微生物污染防治与清除。在合理的使用剂量下,不会对植物的生长(如种子萌发,愈伤增殖、再生等)产生任何影响,可视为培养基标准配方成份;
  2. 作用效果好——PPMTM主要用于预防和消除来自空气、水源或者人体接触等外界因素导致的植物组培过程中的微生物污染,同时,对于植物内生菌也同样具有非常好的抑制效果;
  3. 适用物种广泛——PPMTM广泛适用于绝大多数被子植物和裸子植物;
  4. 使用方便——PPMTM具有热稳定性,能直接加入培养基高温灭菌而不会影响使用效果,使用更加方便;
  5. 性价比高——PPMTM 相对于常规抗生素而言,用量低,性价比更高。

相对抗生素的优势:

  1. PPM TM能广泛抑制和清除细菌和真菌的污染,并防止真菌孢子的萌发;
  2. PPM TM是通过抑制多种酶的活性而达到抑菌效果,从而能避免耐药突变体的发生;
  3. PPM TM具有热稳定性,无需过滤灭菌,能直接加入培养基高温灭菌而不会影响使用效果,使用更加方便;
  4. PPM TM性价比更高,可更加广泛的应用于更多的科学研究、作物育种、组培苗工厂化生产中。

使用方法:
以下使用指南是针对大多数情况下的常规使用说明,特殊情况可做适当调整。

使用指南

污染预防

消毒灭菌

抑制农杆菌

浓度 (v/v)

0.05 – 0.2%

5.0% (see note)

0.05%

处理时间

持续

4 – 12 hours

持续

说明

1. 具体使用浓度根据处理样本有所不同;
2.原生质体和愈伤组织处理浓度建议为0.05%;

1. 将组织加入到含5%PPM™的3X MS*盐溶液中,搅拌4-12小时;
2. 处理过程中无需其他灭菌方法同时使用,不能添加酸碱试剂,调节pH,也不要加入Tween20等;
3.处理完成以后将组织转移到含0.05% PPM的培养基中;

与其他抗生素配合使用效果更佳

*说明:MS盐溶液是泛指,如样本的培养基盐溶液不是MS盐,以具体适用的培养基盐溶液为准;
更多详细使用问题,可咨询全国客服热线021-50837765

产品专利说明:

PPMTM – Plant Preservative Mixture是专利产品,其商品名称,配方及使用方法等都受专利保护,专利号5,750,402。