genecopoeia:一体化qPCR混合物(All-in-One™ qPCR Mix)简述

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带有经验证引物的all-in-One qPCR混合物提供通用的qPCR反应条件和可靠的定量PCR数据。联合开发和共同优化的一体化qPCR混合物和基因特异性引物提供了您所需的全部优势,而没有您预期的任何高成本:

  • 统一的反应条件减少了实验设计时间,从而能够更早提交期刊论文
  • 即使是低拷贝基因也具有高扩增效率和灵敏度,这意味着每次都可以进行可靠的定量
  • 不存在非特异性扩增*和引物二聚体*确保了数据的可再现性和可发布性

一体化qPCR混合物使用高保真热启动聚合酶、优化的反应缓冲液和高质量dNTPs,即使从低拷贝RNA(cDNA)或DNA物种中也能进行特异性和灵敏的扩增(图1)。

genecopoeia:一体化qPCR混合物(All-in-One™ qPCR Mix)简述

图一。使用一体化qPCR主混合物进行qPCR反应。使用GeneCopoeia全合一cDNA合成试剂盒对来自MCF-7细胞的1微克总RNA进行逆转录。将RT反应物稀释至1毫克至1毫克RNA /升。使用GeneCopoeia All-in-One qPCR混合物(A)将1升稀释的RT反应物用于随后的qPCR中35个循环。最终产物在2%琼脂糖凝胶上进行电泳(B)。

 

 

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放大曲线 熔化曲线 标准曲线

 

图二。2X All-in-One qPCR混合物的扩增效率和检测灵敏度通过标准曲线进行评估,该标准曲线由5×10的质粒DNA梯度稀释而成6到5个分子。扩增和解链曲线的峰值表明,使用All-in-One qPCR Mix可以获得非常高的灵敏度,可以检测低至5个分子。同时,每个浓度之间良好的线性关系也显示了高扩增效率。

一体化qPCR验证引物完成任务

使用GeneCopoeia的precision qPCR消除无休止的调整和优化。只需添加多合一底漆并开始。一体式qPCR人-小鼠或大鼠特异性引物由专有算法设计并经过验证精密性能。引物验证包括解链曲线,以确保扩增正确的靶DNA(图2)。

 

当与多合一SYBR结合使用时®Green qPCR Mix,多合一引物在定量PCR检测中提供可靠且可重现的高性能。

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放大曲线
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熔化曲线 琼脂糖凝胶电泳验证结果

 

图三。45对基因特异性All-in-One qPCR引物经过实验验证,可产生单一解离曲线峰,并对目标基因产生正确大小的单一扩增。将包含来自10种不同人类组织(肺、肝、睾丸、卵巢、脾、脑、胎盘、胰腺、心脏和乳腺)的总RNA的逆转录产物的cDNA库用作qPCR验证模板。使用0.2 M引物和2X多合一qPCR混合物进行qPCR。将反应物孵育10分钟。在95℃下,随后在10秒内进行40次95℃的循环。;60摄氏度20秒。72摄氏度15秒。使用Bio-Rad iQ5仪器。最后一个循环结束时,温度从72℃升至95℃,形成一条熔化曲线。显示了10个样品的扩增曲线、解链曲线和琼脂糖凝胶电泳(奇数泳道中阳性和偶数泳道中无模板对照(NTC)的验证结果)。

*当一体式验证PCR引物和PCR混合物一起使用时,确保非特异性扩增和引物二聚体的缺失。自动验证适用于人类、小鼠和大鼠的引物。查询其他物种的验证。

什么是 DNA 净化?

什么是 DNA 净化?

DNA 净化,也称为磁珠净化,是指从样品混合物中定向去除小 DNA 片段,例如引物、接头和二聚体,用于下游 PCR、DNA 连接/克隆或 DNA 文库等。

有时,有些人所说的DNA净化可能指的是去除DNA提取过程中实际涉及的其他物质,例如盐、蛋白质和酶等。我们可以称之为预清理。

因此,现在通过DNA净化,我们特别关注引物、接头以及由引物或接头形成的二聚体,因为它们也是由DNA寡核苷酸形成的。也就是说它们也是DNA片段。当这些碎片在样品中以高比例存在时。它们可能会导致各种问题并干扰 NGS 仪器上的正确测序,例如它们可能会占用大量测序容量并导致触发许多 QC 指标。它们可能会导致 NGS 对齐错误和增加未对齐读取,从而损害数据质量。

有效的 DNA 净化可以提高 PCR 和测序效率、改进数据,甚至可以对低输入样品进行测序,并节省资金。

NVIGEN 磁性纳米颗粒可实现 DNA 产品的 DNA 净化。它们可用于 PCR 产物净化、NGS(下一代测序)文库构建、终止子染料去除以及从测定样品(例如细胞裂解物)中去除其他污染物。